Protein–RNA interactions for Protein: A6NN92

GJE1, Gap junction epsilon-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJE1A6NN92 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJE1A6NN92 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJE1A6NN92 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GJE1A6NN92 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJE1A6NN92 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJE1A6NN92 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJE1A6NN92 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GJE1A6NN92 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GJE1A6NN92 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJE1A6NN92 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJE1A6NN92 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJE1A6NN92 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJE1A6NN92 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJE1A6NN92 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJE1A6NN92 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GJE1A6NN92 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJE1A6NN92 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GJE1A6NN92 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJE1A6NN92 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJE1A6NN92 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJE1A6NN92 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJE1A6NN92 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJE1A6NN92 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJE1A6NN92 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GJE1A6NN92 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJE1A6NN92 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJE1A6NN92 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJE1A6NN92 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJE1A6NN92 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJE1A6NN92 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJE1A6NN92 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GJE1A6NN92 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJE1A6NN92 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJE1A6NN92 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJE1A6NN92 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJE1A6NN92 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GJE1A6NN92 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GJE1A6NN92 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJE1A6NN92 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJE1A6NN92 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJE1A6NN92 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJE1A6NN92 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJE1A6NN92 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJE1A6NN92 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJE1A6NN92 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJE1A6NN92 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJE1A6NN92 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJE1A6NN92 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GJE1A6NN92 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJE1A6NN92 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJE1A6NN92 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GJE1A6NN92 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
GJE1A6NN92 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GJE1A6NN92 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJE1A6NN92 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJE1A6NN92 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJE1A6NN92 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJE1A6NN92 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJE1A6NN92 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJE1A6NN92 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJE1A6NN92 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJE1A6NN92 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJE1A6NN92 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GJE1A6NN92 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJE1A6NN92 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GJE1A6NN92 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJE1A6NN92 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJE1A6NN92 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJE1A6NN92 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJE1A6NN92 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJE1A6NN92 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJE1A6NN92 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJE1A6NN92 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJE1A6NN92 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJE1A6NN92 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJE1A6NN92 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GJE1A6NN92 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJE1A6NN92 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJE1A6NN92 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GJE1A6NN92 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJE1A6NN92 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJE1A6NN92 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GJE1A6NN92 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GJE1A6NN92 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJE1A6NN92 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJE1A6NN92 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GJE1A6NN92 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GJE1A6NN92 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJE1A6NN92 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJE1A6NN92 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJE1A6NN92 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GJE1A6NN92 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJE1A6NN92 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJE1A6NN92 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJE1A6NN92 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJE1A6NN92 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJE1A6NN92 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJE1A6NN92 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJE1A6NN92 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJE1A6NN92 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms