Protein–RNA interactions for Protein: A4D0T7

SMIM30, Small integral membrane protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM30A4D0T7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMIM30A4D0T7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMIM30A4D0T7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMIM30A4D0T7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SMIM30A4D0T7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMIM30A4D0T7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMIM30A4D0T7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMIM30A4D0T7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SMIM30A4D0T7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMIM30A4D0T7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMIM30A4D0T7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMIM30A4D0T7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMIM30A4D0T7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMIM30A4D0T7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMIM30A4D0T7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMIM30A4D0T7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMIM30A4D0T7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMIM30A4D0T7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMIM30A4D0T7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMIM30A4D0T7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMIM30A4D0T7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMIM30A4D0T7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMIM30A4D0T7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMIM30A4D0T7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SMIM30A4D0T7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMIM30A4D0T7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMIM30A4D0T7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMIM30A4D0T7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMIM30A4D0T7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMIM30A4D0T7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMIM30A4D0T7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMIM30A4D0T7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMIM30A4D0T7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMIM30A4D0T7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMIM30A4D0T7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMIM30A4D0T7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMIM30A4D0T7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMIM30A4D0T7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMIM30A4D0T7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMIM30A4D0T7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMIM30A4D0T7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMIM30A4D0T7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMIM30A4D0T7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMIM30A4D0T7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMIM30A4D0T7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMIM30A4D0T7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMIM30A4D0T7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMIM30A4D0T7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SMIM30A4D0T7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMIM30A4D0T7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMIM30A4D0T7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMIM30A4D0T7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMIM30A4D0T7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SMIM30A4D0T7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMIM30A4D0T7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMIM30A4D0T7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SMIM30A4D0T7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMIM30A4D0T7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMIM30A4D0T7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMIM30A4D0T7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMIM30A4D0T7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMIM30A4D0T7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMIM30A4D0T7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMIM30A4D0T7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMIM30A4D0T7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMIM30A4D0T7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMIM30A4D0T7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMIM30A4D0T7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMIM30A4D0T7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMIM30A4D0T7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SMIM30A4D0T7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMIM30A4D0T7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMIM30A4D0T7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMIM30A4D0T7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMIM30A4D0T7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMIM30A4D0T7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMIM30A4D0T7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMIM30A4D0T7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMIM30A4D0T7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMIM30A4D0T7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SMIM30A4D0T7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMIM30A4D0T7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMIM30A4D0T7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMIM30A4D0T7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMIM30A4D0T7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMIM30A4D0T7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMIM30A4D0T7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMIM30A4D0T7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMIM30A4D0T7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMIM30A4D0T7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMIM30A4D0T7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SMIM30A4D0T7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMIM30A4D0T7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMIM30A4D0T7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMIM30A4D0T7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SMIM30A4D0T7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SMIM30A4D0T7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMIM30A4D0T7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMIM30A4D0T7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMIM30A4D0T7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms