Protein–RNA interactions for Protein: A2RU48

SMCO3, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO3A2RU48 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMCO3A2RU48 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMCO3A2RU48 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
SMCO3A2RU48 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMCO3A2RU48 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMCO3A2RU48 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMCO3A2RU48 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMCO3A2RU48 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMCO3A2RU48 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMCO3A2RU48 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMCO3A2RU48 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMCO3A2RU48 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMCO3A2RU48 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMCO3A2RU48 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMCO3A2RU48 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMCO3A2RU48 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMCO3A2RU48 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMCO3A2RU48 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMCO3A2RU48 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMCO3A2RU48 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMCO3A2RU48 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMCO3A2RU48 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMCO3A2RU48 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMCO3A2RU48 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMCO3A2RU48 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMCO3A2RU48 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMCO3A2RU48 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMCO3A2RU48 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMCO3A2RU48 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMCO3A2RU48 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMCO3A2RU48 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMCO3A2RU48 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMCO3A2RU48 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SMCO3A2RU48 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMCO3A2RU48 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SMCO3A2RU48 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMCO3A2RU48 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMCO3A2RU48 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMCO3A2RU48 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMCO3A2RU48 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.6 ms