Protein–RNA interactions for Protein: A0PJW6

TMEM223, Transmembrane protein 223, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM223A0PJW6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM223A0PJW6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM223A0PJW6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM223A0PJW6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM223A0PJW6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM223A0PJW6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TMEM223A0PJW6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM223A0PJW6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms