Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YVX5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YVX5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A0J9YVX5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A0J9YVX5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A0J9YVX5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
A0A0J9YVX5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A0J9YVX5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A0J9YVX5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A0J9YVX5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A0J9YVX5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A0J9YVX5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A0J9YVX5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A0A0J9YVX5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A0J9YVX5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A0J9YVX5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
A0A0J9YVX5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A0J9YVX5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A0J9YVX5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A0J9YVX5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A0J9YVX5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A0A0J9YVX5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A0J9YVX5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A0J9YVX5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A0J9YVX5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A0J9YVX5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
A0A0J9YVX5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
A0A0J9YVX5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A0J9YVX5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A0J9YVX5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A0J9YVX5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A0J9YVX5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A0J9YVX5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A0J9YVX5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A0J9YVX5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
A0A0J9YVX5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0J9YVX5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0J9YVX5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0J9YVX5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0J9YVX5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0J9YVX5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0J9YVX5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
A0A0J9YVX5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A0J9YVX5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A0J9YVX5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A0J9YVX5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A0J9YVX5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
A0A0J9YVX5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A0J9YVX5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A0J9YVX5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A0J9YVX5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
A0A0J9YVX5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0J9YVX5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0J9YVX5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0J9YVX5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0J9YVX5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0J9YVX5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0J9YVX5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
A0A0J9YVX5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0J9YVX5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0J9YVX5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0J9YVX5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0J9YVX5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
A0A0J9YVX5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0J9YVX5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0J9YVX5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0J9YVX5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0J9YVX5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
A0A0J9YVX5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0J9YVX5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0J9YVX5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0J9YVX5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0J9YVX5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0J9YVX5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0J9YVX5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0J9YVX5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0J9YVX5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0J9YVX5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0J9YVX5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0J9YVX5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
A0A0J9YVX5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0J9YVX5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0J9YVX5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0J9YVX5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
A0A0J9YVX5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0J9YVX5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0J9YVX5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0J9YVX5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
A0A0J9YVX5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0J9YVX5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0J9YVX5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0J9YVX5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0J9YVX5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0J9YVX5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0J9YVX5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0J9YVX5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
A0A0J9YVX5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0J9YVX5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0J9YVX5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0J9YVX5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0J9YVX5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
A0A0J9YVX5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms