Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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ARL2-SNX15V9GYD0 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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ARL2-SNX15V9GYD0 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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ARL2-SNX15V9GYD0 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ARL2-SNX15V9GYD0 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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