Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
POLR1DQ9Y2S0 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR1DQ9Y2S0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms