Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y252

RNF6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF6Q9Y252 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF6Q9Y252 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms