Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SHANK2Q9UPX8 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms