Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FOXD3Q9UJU5 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms