Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CHRNA9Q9UGM1 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms