Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms