Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF33

EPHA6, Ephrin type-A receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA6Q9UF33 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EPHA6Q9UF33 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms