Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

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Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTSFQ9UBX1 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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