Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KLHL42Q9P2K6 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms