Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLHL9Q9P2J3 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms