Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ3

NCKIPSD, NCK-interacting protein with SH3 domain, humanhuman

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKIPSDQ9NZQ3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCKIPSDQ9NZQ3 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms