Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GDAP2Q9NXN4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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