Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CTPS2Q9NRF8 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CTPS2Q9NRF8 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms