Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE1

MMP26, Matrix metalloproteinase-26, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP26Q9NRE1 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MMP26Q9NRE1 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MMP26Q9NRE1 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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