Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RAB18Q9NP72 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
RAB18Q9NP72 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
RAB18Q9NP72 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms