Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP31

SH2D2A, SH2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D2AQ9NP31 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SH2D2AQ9NP31 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 355.4 ms