Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP4F12Q9HCS2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms