Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F0

ASXL3, Putative Polycomb group protein ASXL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASXL3Q9C0F0 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASXL3Q9C0F0 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASXL3Q9C0F0 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASXL3Q9C0F0 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ASXL3Q9C0F0 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ASXL3Q9C0F0 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASXL3Q9C0F0 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASXL3Q9C0F0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASXL3Q9C0F0 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASXL3Q9C0F0 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASXL3Q9C0F0 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASXL3Q9C0F0 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASXL3Q9C0F0 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASXL3Q9C0F0 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASXL3Q9C0F0 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASXL3Q9C0F0 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASXL3Q9C0F0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASXL3Q9C0F0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASXL3Q9C0F0 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASXL3Q9C0F0 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASXL3Q9C0F0 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASXL3Q9C0F0 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASXL3Q9C0F0 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASXL3Q9C0F0 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASXL3Q9C0F0 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASXL3Q9C0F0 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASXL3Q9C0F0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ASXL3Q9C0F0 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASXL3Q9C0F0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASXL3Q9C0F0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASXL3Q9C0F0 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASXL3Q9C0F0 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASXL3Q9C0F0 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASXL3Q9C0F0 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASXL3Q9C0F0 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ASXL3Q9C0F0 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASXL3Q9C0F0 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASXL3Q9C0F0 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ASXL3Q9C0F0 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASXL3Q9C0F0 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ASXL3Q9C0F0 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASXL3Q9C0F0 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASXL3Q9C0F0 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ASXL3Q9C0F0 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ASXL3Q9C0F0 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASXL3Q9C0F0 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASXL3Q9C0F0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASXL3Q9C0F0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASXL3Q9C0F0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASXL3Q9C0F0 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASXL3Q9C0F0 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASXL3Q9C0F0 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASXL3Q9C0F0 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASXL3Q9C0F0 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASXL3Q9C0F0 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASXL3Q9C0F0 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASXL3Q9C0F0 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ASXL3Q9C0F0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASXL3Q9C0F0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASXL3Q9C0F0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASXL3Q9C0F0 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASXL3Q9C0F0 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASXL3Q9C0F0 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASXL3Q9C0F0 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASXL3Q9C0F0 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASXL3Q9C0F0 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASXL3Q9C0F0 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASXL3Q9C0F0 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASXL3Q9C0F0 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ASXL3Q9C0F0 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ASXL3Q9C0F0 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASXL3Q9C0F0 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASXL3Q9C0F0 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASXL3Q9C0F0 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASXL3Q9C0F0 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASXL3Q9C0F0 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASXL3Q9C0F0 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASXL3Q9C0F0 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ASXL3Q9C0F0 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASXL3Q9C0F0 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASXL3Q9C0F0 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASXL3Q9C0F0 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ASXL3Q9C0F0 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASXL3Q9C0F0 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASXL3Q9C0F0 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASXL3Q9C0F0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASXL3Q9C0F0 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ASXL3Q9C0F0 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ASXL3Q9C0F0 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ASXL3Q9C0F0 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ASXL3Q9C0F0 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASXL3Q9C0F0 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASXL3Q9C0F0 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASXL3Q9C0F0 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASXL3Q9C0F0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASXL3Q9C0F0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASXL3Q9C0F0 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASXL3Q9C0F0 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASXL3Q9C0F0 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ASXL3Q9C0F0 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms