Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CIPCQ9C0C6 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CIPCQ9C0C6 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms