Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B6

BRINP2, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP2Q9C0B6 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
BRINP2Q9C0B6 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BRINP2Q9C0B6 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms