Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
FOXQ1Q9C009 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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