Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS1

KRTAP1-5, Keratin-associated protein 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-5Q9BYS1 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
KRTAP1-5Q9BYS1 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
KRTAP1-5Q9BYS1 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
KRTAP1-5Q9BYS1 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
KRTAP1-5Q9BYS1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
KRTAP1-5Q9BYS1 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
KRTAP1-5Q9BYS1 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
KRTAP1-5Q9BYS1 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
KRTAP1-5Q9BYS1 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
KRTAP1-5Q9BYS1 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms