Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR4

KRTAP4-3, Keratin-associated protein 4-3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-3Q9BYR4 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
KRTAP4-3Q9BYR4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms