Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXR3

ERVK-6, Endogenous retrovirus group K member 6 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-6Q9BXR3 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK-6Q9BXR3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK-6Q9BXR3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK-6Q9BXR3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK-6Q9BXR3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-6Q9BXR3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-6Q9BXR3 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-6Q9BXR3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-6Q9BXR3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-6Q9BXR3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-6Q9BXR3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-6Q9BXR3 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-6Q9BXR3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-6Q9BXR3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-6Q9BXR3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-6Q9BXR3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-6Q9BXR3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-6Q9BXR3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-6Q9BXR3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-6Q9BXR3 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-6Q9BXR3 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-6Q9BXR3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-6Q9BXR3 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-6Q9BXR3 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-6Q9BXR3 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-6Q9BXR3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-6Q9BXR3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-6Q9BXR3 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-6Q9BXR3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-6Q9BXR3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-6Q9BXR3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-6Q9BXR3 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-6Q9BXR3 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-6Q9BXR3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-6Q9BXR3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-6Q9BXR3 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-6Q9BXR3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVK-6Q9BXR3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVK-6Q9BXR3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVK-6Q9BXR3 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVK-6Q9BXR3 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVK-6Q9BXR3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVK-6Q9BXR3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVK-6Q9BXR3 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVK-6Q9BXR3 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVK-6Q9BXR3 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVK-6Q9BXR3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVK-6Q9BXR3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVK-6Q9BXR3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ERVK-6Q9BXR3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ERVK-6Q9BXR3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms