Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
HIGD2AQ9BW72 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
HIGD2AQ9BW72 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms