Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C9orf16Q9BUW7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms