Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLR3CQ9BUI4 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms