Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM43Q9BTV4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM43Q9BTV4 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms