Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGIP1Q9BQI5 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGIP1Q9BQI5 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGIP1Q9BQI5 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGIP1Q9BQI5 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGIP1Q9BQI5 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGIP1Q9BQI5 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGIP1Q9BQI5 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGIP1Q9BQI5 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGIP1Q9BQI5 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SGIP1Q9BQI5 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SGIP1Q9BQI5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SGIP1Q9BQI5 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SGIP1Q9BQI5 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SGIP1Q9BQI5 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SGIP1Q9BQI5 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
SGIP1Q9BQI5 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SGIP1Q9BQI5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SGIP1Q9BQI5 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SGIP1Q9BQI5 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms