Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ95

ECSIT, Evolutionarily conserved signaling intermediate in Toll pathway, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECSITQ9BQ95 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECSITQ9BQ95 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECSITQ9BQ95 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECSITQ9BQ95 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECSITQ9BQ95 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ECSITQ9BQ95 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECSITQ9BQ95 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ECSITQ9BQ95 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECSITQ9BQ95 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECSITQ9BQ95 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECSITQ9BQ95 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECSITQ9BQ95 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECSITQ9BQ95 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECSITQ9BQ95 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ECSITQ9BQ95 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECSITQ9BQ95 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECSITQ9BQ95 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECSITQ9BQ95 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECSITQ9BQ95 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECSITQ9BQ95 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECSITQ9BQ95 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECSITQ9BQ95 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECSITQ9BQ95 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ECSITQ9BQ95 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ECSITQ9BQ95 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms