Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DUSP9Q99956 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DUSP9Q99956 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms