Protein–RNA interactions for Protein: Q99742

NPAS1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1Q99742 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NPAS1Q99742 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms