Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
LINC00208Q96KT6 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
LINC00208Q96KT6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms