Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG3Q96JB2 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms