Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
RNF185Q96GF1 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms