Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HLA-CQ95604 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HLA-CQ95604 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms