Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
BHMTQ93088 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms