Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CTTNBP2Q8WZ74 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CTTNBP2Q8WZ74 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CTTNBP2Q8WZ74 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTTNBP2Q8WZ74 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTTNBP2Q8WZ74 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTTNBP2Q8WZ74 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTTNBP2Q8WZ74 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTTNBP2Q8WZ74 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTTNBP2Q8WZ74 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTTNBP2Q8WZ74 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTTNBP2Q8WZ74 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTTNBP2Q8WZ74 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTTNBP2Q8WZ74 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTTNBP2Q8WZ74 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTTNBP2Q8WZ74 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CTTNBP2Q8WZ74 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTTNBP2Q8WZ74 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTTNBP2Q8WZ74 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTTNBP2Q8WZ74 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms