Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB7

RNF128, E3 ubiquitin-protein ligase RNF128, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF128Q8TEB7 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF128Q8TEB7 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms