Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGSF1Q8N6C5 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGSF1Q8N6C5 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms