Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APTXQ7Z2E3 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms