Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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LINC00299Q6ZSB3 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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LINC00299Q6ZSB3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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LINC00299Q6ZSB3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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LINC00299Q6ZSB3 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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LINC00299Q6ZSB3 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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LINC00299Q6ZSB3 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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LINC00299Q6ZSB3 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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LINC00299Q6ZSB3 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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LINC00299Q6ZSB3 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
LINC00299Q6ZSB3 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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