Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HACD2Q6Y1H2 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms