Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ZCCHC12Q6PEW1 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZCCHC12Q6PEW1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms